Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Fam227bQ9D518 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms