Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V7

Rabl3, Rab-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 236 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rabl3Q9D4V7 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rabl3Q9D4V7 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Rabl3Q9D4V7 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms