Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Efhd1Q9D4J1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Efhd1Q9D4J1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms