Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X3

4933428M09Rik, RIKEN cDNA 4933428M09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428M09RikQ9D3X3 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4933428M09RikQ9D3X3 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Mavs-202ENSMUST00000110199 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4933428M09RikQ9D3X3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms