Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Creb3l4Q9D2A5 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Creb3l4Q9D2A5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms