Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Tmem53Q9D0Z3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Tmem53Q9D0Z3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms