Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms