Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY28

Gtpbp8, GTP-binding protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtpbp8Q9CY28 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp8Q9CY28 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp8Q9CY28 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp8Q9CY28 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp8Q9CY28 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
Gtpbp8Q9CY28 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
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Gtpbp8Q9CY28 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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Gtpbp8Q9CY28 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Gtpbp8Q9CY28 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
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