Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY18

Snx7, Sorting nexin-7, mousemouse

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx7Q9CY18 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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Snx7Q9CY18 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Snx7Q9CY18 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms