Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Sgo1Q9CXH7 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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