Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

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Length 219 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
RpainQ9CWY9 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
RpainQ9CWY9 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
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