Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX4

Rpusd4, Mitochondrial RNA pseudouridine synthase Rpusd4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd4Q9CWX4 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Rpusd4Q9CWX4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpusd4Q9CWX4 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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