Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWP4

Ly6k, Lymphocyte antigen 6K, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly6kQ9CWP4 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ly6kQ9CWP4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ly6kQ9CWP4 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms