Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Sft2d3Q9CSV6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Sft2d3Q9CSV6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms