Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Pard3bQ9CSB4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Pard3bQ9CSB4 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
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