Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQU3

Rer1, Protein RER1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rer1Q9CQU3 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Rer1Q9CQU3 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
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