Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQS5

Riok2, Serine/threonine-protein kinase RIO2, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok2Q9CQS5 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Riok2Q9CQS5 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Riok2Q9CQS5 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms