Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD1

Rab5a, Ras-related protein Rab-5A, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab5aQ9CQD1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Sema4c-201ENSMUST00000114991 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.6□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Stxbp2-207ENSMUST00000160708 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Tmem184c-201ENSMUST00000034030 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 AI593442-203ENSMUST00000213937 5674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC12.58□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Ccdc117-201ENSMUST00000020776 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Rab5aQ9CQD1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm29683-203ENSMUST00000209071 2488 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Rab5aQ9CQD1 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms