Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gpr157-201ENSMUST00000094451 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Cadps2-213ENSMUST00000166458 4598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Cacna1g-209ENSMUST00000107791 8002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.38□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.37□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Hnf4a-202ENSMUST00000109411 4362 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Rpl39lQ9CQD0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms