Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ26

Stambp, STAM-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StambpQ9CQ26 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
StambpQ9CQ26 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Slc8a2-202ENSMUST00000211649 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
StambpQ9CQ26 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms