Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL5

Rrbp1, Ribosome-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrbp1Q99PL5 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm34964-201ENSMUST00000207398 417 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm15747-202ENSMUST00000151096 524 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 AC151828.1-201ENSMUST00000219552 661 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Msmp-201ENSMUST00000107884 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm14767-201ENSMUST00000121559 586 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rrbp1Q99PL5 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rrbp1Q99PL5 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms