Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB3

Tcam1, Cell adhesion molecule TCAM-1, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcam1Q99NB3 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Tcam1Q99NB3 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Tcam1Q99NB3 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms