Protein–RNA interactions for Protein: Q99NA9

Pcgf6, Polycomb group RING finger protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcgf6Q99NA9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Aste1-201ENSMUST00000035181 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Pcgf6Q99NA9 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm37691-201ENSMUST00000192147 2573 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Pcgf6Q99NA9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms