Protein–RNA interactions for Protein: Q99ME3

Sncaip, Synphilin-1, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaipQ99ME3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SncaipQ99ME3 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms