Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY4

Trabd, TraB domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrabdQ99JY4 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
TrabdQ99JY4 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms