Protein–RNA interactions for Protein: Q99JR1

Sfxn1, Sideroflexin-1, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfxn1Q99JR1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sfxn1Q99JR1 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms