Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Tspan1Q99J59 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Tspan1Q99J59 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms