Protein–RNA interactions for Protein: Q920A7

Afg3l1, AFG3-like protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 789 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Afg3l1Q920A7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Afg3l1Q920A7 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.7 ms