Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Snx4Q91YJ2 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Snx4Q91YJ2 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms