Protein–RNA interactions for Protein: Q91XD2

Lims2, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims2Q91XD2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Lims2Q91XD2 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Lims2Q91XD2 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.3 ms