Protein–RNA interactions for Protein: Q91WE6

Cdkal1, Threonylcarbamoyladenosine tRNA methylthiotransferase, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkal1Q91WE6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cdkal1Q91WE6 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 P3h1-203ENSMUST00000102662 2977 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Cdkal1Q91WE6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms