Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
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Smg8Q8VE18 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Smg8Q8VE18 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Smg8Q8VE18 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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