Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0W1

Cipc, CLOCK-interacting pacemaker, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CipcQ8R0W1 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CipcQ8R0W1 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms