Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4P8

Hecw1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hecw1Q8K4P8 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 AC155937.1-202ENSMUST00000156229 621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Hecw1Q8K4P8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 AC159621.2-201ENSMUST00000223519 1326 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm6594-201ENSMUST00000097278 288 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Pus1-207ENSMUST00000170468 1510 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Crhr2-209ENSMUST00000213026 1443 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hecw1Q8K4P8 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms