Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3Y3

Lin28a, Protein lin-28 homolog A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin28aQ8K3Y3 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Lin28aQ8K3Y3 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms