Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Trappc12Q8K2L8 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Trappc12Q8K2L8 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms