Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Brd3Q8K2F0 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Brd3Q8K2F0 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms