Protein–RNA interactions for Protein: Q8K268

Abcf3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcf3Q8K268 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Tomm6os-201ENSMUST00000155812 2944 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Abcf3Q8K268 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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Abcf3Q8K268 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
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