Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR6

Slc4a8, Electroneutral sodium bicarbonate exchanger 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a8Q8JZR6 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Slc4a8Q8JZR6 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.2 ms