Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
LgsnQ8CIX8 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms