Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
SbsnQ8CIT9 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
SbsnQ8CIT9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms