Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI71

Vps50, Syndetin, mousemouse

Predictions only

Length 964 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps50Q8CI71 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vps50Q8CI71 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms