Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Mterf1aQ8CHZ9 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms