Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHB8

Ttll5, Tubulin polyglutamylase TTLL5, mousemouse

Predictions only

Length 1,328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll5Q8CHB8 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttll5Q8CHB8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ttll5Q8CHB8 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms