Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFD5

Ercc8, DNA excision repair protein ERCC-8, mousemouse

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc8Q8CFD5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
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Ercc8Q8CFD5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Ercc8Q8CFD5 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms