Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Usp27Q8CEG8 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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Usp27Q8CEG8 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Usp27Q8CEG8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Usp27Q8CEG8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
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Usp27Q8CEG8 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Usp27Q8CEG8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
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Usp27Q8CEG8 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Usp27Q8CEG8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Usp27Q8CEG8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Usp27Q8CEG8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
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Usp27Q8CEG8 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
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