Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEE7

Rdh13, Retinol dehydrogenase 13, mousemouse

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh13Q8CEE7 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rdh13Q8CEE7 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
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Rdh13Q8CEE7 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh13Q8CEE7 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rdh13Q8CEE7 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rdh13Q8CEE7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
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Rdh13Q8CEE7 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh13Q8CEE7 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
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