Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEC5

Nkiras1, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 192 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkiras1Q8CEC5 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Dgke-201ENSMUST00000000285 5208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Aspm-205ENSMUST00000200083 6072 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nkiras1Q8CEC5 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Creg2-201ENSMUST00000053355 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nkiras1Q8CEC5 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms