Protein–RNA interactions for Protein: Q8C5N3

Cwc22, Pre-mRNA-splicing factor CWC22 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cwc22Q8C5N3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Cwc22Q8C5N3 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
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