Protein–RNA interactions for Protein: Q8BXT9

Sec22c, Vesicle-trafficking protein SEC22c, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22cQ8BXT9 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22cQ8BXT9 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sec22cQ8BXT9 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec22cQ8BXT9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sec22cQ8BXT9 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Sec22cQ8BXT9 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Sec22cQ8BXT9 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms